Το καλοκαίρι του 2007 ήρθε στον ΑΠΟΕΛ και 11 χρόνια μετά υπογράφει την ανανέωση του συμβολαίου του μέχρι το 2019. Δηλαδή ο 34χρονος Πορτογάλος θα κλείσει 12 γεμάτες σεζόν με την γαλαζοκίτρινη φανέλα.
Ο Νούνο Μοράις έκανε ντεμπούτο με τον ΑΠΟΕΛ στο κάζο με την Μπάτε. Στο ΓΣΠ ο Πορτογάλος έκανε ντεμπούτο στις 17 Ιουλίου με την Μπάτε στον πρώτο αγώνα όταν ο ΑΠΟΕΛ κέρδισε με 2-0. Εκείνη τη χρονιά, οι γαλαζοκίτρινοι γνώρισαν ένα μεγάλο κάζο, αφού έχασαν με 2-0 στην κανονική διάρκεια και οι Λευκορώσοι προκρίθηκαν στην παράταση.
11 χρόνια μετά ο Νούνο Μοράις είναι ένας ζωντανός θρύλος για τον ΑΠΟΕΛ, ο οποίος κατέκτησε οκτώ πρωτάθλημα με τα έξι να είναι στα τελευταία έξι χρόνια.
Ο απολογισμός του με τη φανέλα του ΑΠΟΕΛ εντυπωσιακός. 8 πρωταθλήματα, 3 κύπελλα, 4 σούπερ καπ, 4 προκρίσεις σε ομίλους Τσάμπιονς Λιγκ και 4 σε ομίλους Γιουρόπα Λιγκ. Και όλα αυτά συνεχίζονται, αφού ο Νούνο θα είναι κάτοικος Αρχαγγέλου για τουλάχιστον ακόμα ένα χρόνο.
